Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm2Q5FW85 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm2Q5FW85 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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