Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms