Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc8bQ5DU41 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms