Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfmbt2Q5DTW2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms