Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms