Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spire1Q52KF3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spire1Q52KF3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms