Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opa3Q505D7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opa3Q505D7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opa3Q505D7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opa3Q505D7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opa3Q505D7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms