Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms