Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc84Q4VA36 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms