Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf109Q499E6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf109Q499E6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms