Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms