Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms