Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms