Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Esf1Q3V1V3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms