Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap2Q3V1H1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms