Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk4Q3V129 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms