Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc110Q3V125 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms