Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933416C03RikQ3V063 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms