Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms