Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc114Q3UX62 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms