Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca4bQ3UW98 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms