Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn13Q3UW68 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn13Q3UW68 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms