Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D130052B06RikQ3UW13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
D130052B06RikQ3UW13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms