Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr1d1Q3UV55 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms