Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1lQ3USQ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1lQ3USQ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms