Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28047Q3US59 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms