Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elf3Q3UPW2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elf3Q3UPW2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms