Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc4Q3UP24 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms