Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms