Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cog7Q3UM29 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog7Q3UM29 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms