Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms