Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms