Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms