Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc61Q3UJV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms