Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms