Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod2Q3UHZ5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms