Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms