Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms