Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LchnQ3UHG7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms