Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms