Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Garem1Q3UFT3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garem1Q3UFT3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms