Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde4cQ3UEI1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde4cQ3UEI1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms