Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Puf60Q3UEB3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Puf60Q3UEB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms