Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms