Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms