Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TraddQ3U0V2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms