Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Palb2Q3U0P1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms