Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn4clQ3TYX2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lrrn4clQ3TYX2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lrrn4clQ3TYX2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lrrn4clQ3TYX2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn4clQ3TYX2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lrrn4clQ3TYX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms