Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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