Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdpd4Q3TT99 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms